Koper stosuje się podobnie jak kminek – posypuje się nim ciasta oraz pieczywo, zwłaszcza żytnie. Należy go stosować z umiarem, ponieważ jego smak potrafi przytłoczyć potrawę. Smak kopru współgra z wszelkiego rodzaju sosami jogurtowymi i ze śmietaną.
Świeże posiekane liście kopru często wykorzystuje się jako dodatek do pstrąga i łososia, krewetek, jajek, zielonej fasoli, kalafiora, buraków, zup oraz serka wiejskiego i ziemniaków, w szczególności pasuje do ziemniaków młodych. Koper jako składnik jest również stosowany do kapusty kiszonej, ogórków kiszonych, pikli i różnego rodzaju octów, znany jest od wieków.